Desde enero de 2010 se inició el proceso de fusión por absorción entre Petroamazonas EP y la Gerencia de Producción de Petroecuador (antes Petroproducción). Desde el 1 de noviembre de 2012, por decreto presidencial, Petroamazonas EP tomó de manera oficial las operaciones de los campos Lago Agrio, Libertador, Shushufindi, Auca, Cuyabeno y operaciones Off Shore de producción de gas natural de los campos Pacoa y Amistad, que eran responsabilidad de la Gerencia de Exploración y Producción de Petroecuador.
A partir del 2 de enero de 2013, fecha en la que se hizo efectivo el decreto, Petroamazonas EP tiene a cargo la operación de 18 bloques petroleros en el oriente y 3 bloques en la costa. Además a esa fecha contaba con un POES (petróleo original en sitio) total de 13946 MMBls y reservas remanentes totales de 1609 MMBls.2
